Kontynuacja wydarzeń z The Clone Conspiracy #1.
Podziemia siedziby New U. Laboratorium Jackala. Doctor Octopus, trzymając Spider-Mana w uścisku macek, opowiada superbohaterowi, w jaki sposób udało mu się powrócić do świata żywych.
Kilka dni temu. Manhattan. Przechowujący świadomość Otto Octaviusa Octobot ucieka z płonącej pracowni w Parker Industries. Za radą wirtualnej Anny Marii Marconi – wzorowanej na jego ukochanej sztucznej inteligencji z 2099 roku – przyczepia się do furgonetki i dociera na cmentarz Potter’s Field, gdzie pochowano jego ciało. Chcąc pobrać materiał genetyczny do wyhodowania nowego ciała, odkrywa brak trumny. Okazuje się, że zwłoki zniknęły też z grobów Alistaire’a Smythe’a i innych super-kryminalistów.
W ramach śledztwa Octobot podłącza się do komórki koszącego trawę pracownika cmentarza i dzięki zaawansowanej technologii Anny Marii włamuje się do globalnej sieci. Tam podsłuchuje rozmowę handlarzy drogocennych zwłok z przedstawicielami New U, zainteresowanej tym „towarem” firmy biomedycznej Jackala. Nie zwlekając Otto jako robocik udaje się do domu pogrzebowego Serenity Funeral Home i zakrada się do trumny ze swoimi zwłokami.
Prywatne lądowisko na obrzeżach San Francisco. Klony Milesa Warrena po konsultacji ze Jackalem dobijają targu z dilerami Serenity Funeral Home, kupując od nich trumnę z ciałem Dr. Octopusa. Kiedy pakują „towar” do furgonetki New U i odjeżdżają, przygląda im się ukryty w krzakach wysłannik Fiska, który donosi przez telefon szefowi o zakończonej właśnie transakcji. Skanująca otoczenie Anna informuje Otto o obecności trzeciej strony. Octaviusowi zależy jednak tylko na tym, żeby nikt ich nie wykrył.
Siedziba New U. Po pobraniu próbki ze zwłok Jackal, Lizard, Marta Connors i Marla Jameson rozpoczynają proces formowania „Doctora Octopusa 2.0”. Warren tłumaczy, że ciało jest tym, na czym w największym stopniu człowiek odciska swoją pamięć i osobowość, a on potrafi to wszystko odtworzyć. Kiedy trwa hodowla klona, ukryty w robocie Otto uświadamia sobie, że jego ciało umarło przecież ze świadomością Petera Parkera. Nie zwlekając Octobot na oczach wszystkich wskakuje do zbiornika i podłącza się do mózgu duplikatu.
W umyśle „Doctora Octopusa 2.0” świadomość Otto Octaviusa wyzywa świadomość Petera Parkera na pojedynek, którego stawką jest to, kto będzie kontrolował nowe i zdrowe ciało. Mimo początkowych trudności Doc Ock triumfuje i unicestwia osobowość przeciwnika. Przywrócony do życia Dr Octopus wychodzi z komory. Jackal i reszta, którzy byli świadkami jego walki, tak w zbiorniku, jak i na obrazie fal mózgowych, gratulują mu. Niestety po rozładowaniu się Oktobota wirtualna Anna musi pożegnać się i na zawsze odchodzi w niebyt.
Po chwili żałoby Otto zostaje zabrany przez Jackala do pomieszczenia, gdzie znajduje się uprząż z mackami, którą wykradł Prowler. Octavius przywołuje telepatycznie swój rynsztunek, potwierdzając, że jest najprawdziwszym Doctorem Octopusem. Jackal wręcza mu pigułkę, którą ma codziennie zażywać, mówiąc, że to forma polisy ubezpieczeniowej, jednak Otto ma świadomość, że degeneracja klonów to nie celowy zabieg, a defekt, który może pomóc mu usunąć. Naukowcy zawiązują więc partnerstwo dla obopólnych korzyści.
Obecnie. W podziemiach centrali New U wskrzeszony Doctor Octopus przechwala się, że powrócił mądrzejszy i silniejszy niż kiedykolwiek wcześniej. Przyciskając Spider-Mana mackami do ściany, ogłasza swoją wyższość nad nim.
Kontynuacja wydarzeń w The Clone Conspiracy #2.
